RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	LCT	P09848	1927 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157		H0Y626	953 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	TULP3	O75386	442 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	EED	O75530	441 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM16	O95361	564 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	SEC24A	O95486	1093 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ANGPTL1	O95841	491 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	C7	P10643	843 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	CRHBP	P24387	322 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	GSTM2	P28161	218 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	HTR6	P50406	440 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	FPGS	Q05932	587 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	CD47	Q08722	323 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	DGUOK	Q16854	277 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	SDE2	Q6IQ49	451 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ERAP2	Q6P179	960 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	FRS2	Q8WU20	508 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	DIABLO	Q9NR28	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	WDR70	Q9NW82	654 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	AXIN1	O15169	862 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	CACNG3	O60359	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	OR1I1	O60431	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	SEC22B	O75396	215 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	FGF1	P05230	155 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	BMP1	P13497	986 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	HTR1E	P28566	365 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	GRK4	P32298	578 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	STC1	P52823	247 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	STEAP3	Q658P3	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF544	Q6NX49	715 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD46	Q86W74	232 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	OR2T11	Q8NH01	316 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	TM9SF2	Q99805	663 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	VPS4A	Q9UN37	437 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PKP3	Q9Y446	797 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157		F8W810	466 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ARVCF	O00192	962 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	IL12A	P29459	219 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PIGA	P37287	484 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR15	P49685	360 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF599	Q96NL3	588 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ACBD6	Q9BR61	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	GON7	Q9BXV9	100 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	BCKDK	O14874	412 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ALPL	P05186	524 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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