RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058		H3BMQ9	156 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	UROD	P06132	367 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	SRC	P12931	536 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	CYP4F8	P98187	520 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	PPP2R2B	Q00005	443 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	GBX1	Q14549	363 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	GAREM2	Q75VX8	874 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	SVOPL	Q8N434	492 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	LMLN	Q96KR4	655 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	COG8	Q96MW5	612 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	KCNH6	Q9H252	994 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	TOR3A	Q9H497	397 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		16.53	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058		A0A096LPI6	279 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	PRKD3	O94806	890 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	ATE1	O95260	518 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	CST1	P01037	141 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	LHCGR	P22888	699 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	PRPH2	P23942	346 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	AOAH	P28039	575 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	SLC7A9	P82251	487 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	PTS	Q03393	145 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	FAM162A	Q96A26	154 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	PHF12	Q96QT6	1004 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	MBOAT4	Q96T53	435 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	MAFF	Q9ULX9	164 aa		16.52	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	IL1RN	P18510	177 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	GABRR2	P28476	465 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	IST1	P53990	364 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	PON2	Q15165	354 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	GPR107	Q5VW38	600 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	USP45	Q70EL2	814 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	ASIC4	Q96FT7	647 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		16.52	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	CREG1	O75629	220 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	CKM	P06732	381 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	PRPS2	P11908	318 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	PTPN6	P29350	595 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	SLC6A12	P48065	614 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	EPS8	Q12929	822 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	MYBPC3	Q14896	1274 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	TTC23	Q5W5X9	447 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	PARVB	Q9HBI1	364 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	B4GAT1	O43505	415 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	NUAK1	O60285	661 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	C8G	P07360	202 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	C10orf111	Q8N326	155 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		16.51	■□□□□ 0.23
TOM1-210	ENST00000449058	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		16.51	■□□□□ 0.23

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