RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.4□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ATG9BQ674R7 924 aa11.4□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.4□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 RNF31Q96EP0 1072 aa11.4□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.4□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 VWA7Q9Y334 891 aa11.4□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TLL1O43897 1013 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CATP04040 527 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MC1RQ01726 317 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TEX44Q53QW1 395 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TUSC5Q8IXB3 177 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF567Q8N184 647 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 FAIM2Q9BWQ8 316 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TOR3AQ9H497 397 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ASF1AQ9Y294 204 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 BBIP1A8MTZ0 92 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 L7N2F9 121 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PLK4O00444 970 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PGRMC2O15173 223 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 IDO1P14902 403 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 AOC1P19801 751 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TGM4P49221 684 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 VAMP2P63027 116 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SFT2D3Q587I9 215 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 FRMD7Q6ZUT3 714 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TREML1Q86YW5 311 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SOCS4Q8WXH5 440 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SLC38A2Q96QD8 506 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PITPNM1O00562 1244 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 H6PDO95479 791 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 C9P02748 559 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ADRA1BP35368 520 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM198Q66K66 360 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TIGD3Q6B0B8 471 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 AGAP2Q99490 1192 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TEX264Q9Y6I9 313 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CIDEAO60543 219 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SLC5A3P53794 718 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PTPRNQ16849 979 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PDSS2Q86YH6 399 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 POC5Q8NA72 575 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SLIT2O94813 1529 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MYL9P24844 172 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 GPD2P43304 727 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 RABGGTBP53611 331 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 KCNJ11Q14654 390 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 KCNA10Q16322 511 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 VPS26BQ4G0F5 336 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 C3orf38Q5JPI3 329 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 REP15Q6BDI9 236 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 STK40Q8N2I9 435 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PANX1Q96RD7 426 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.39□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 H3BQ06 376 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 AP2A2O94973 939 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MT-ND1P03886 318 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 OR4Q2P0C623 313 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 AXLP30530 894 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 CYP2C18P33260 490 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ASPAP45381 313 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PPP2R2BQ00005 443 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF846Q147U1 533 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SLC26A9Q7LBE3 791 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 QRFPRQ96P65 431 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PHF12Q96QT6 1004 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 SDHAF2Q9NX18 166 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 HSDL1Q3SXM5 330 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 MLIPQ5VWP3 458 aa11.38□□□□□ -0.59
CCBE1-202ENST00000439986 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms