RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF778Q96MU6 729 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 GBP5Q96PP8 586 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 MENTQ9BUN1 341 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 FER1L5A0AVI2 2057 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 NBASA2RRP1 2371 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 TTLL8A6PVC2 850 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 HCRTR1O43613 425 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 DPM1O60762 260 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEP78395 509 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SSPNQ14714 243 aa20.23■□□□□ 0.83
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LIMS1-208ENST00000428064 FAM69BQ5VUD6 431 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC22Q8N4W6 341 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 MED13Q9UHV7 2174 aa20.23■□□□□ 0.83
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LIMS1-208ENST00000428064 GCGRP47871 477 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 DCDP81605 110 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 ATP1A4Q13733 1029 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA3AQ14563 771 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 NADK2Q4G0N4 442 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC89Q8N998 374 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT9Q9BW91 350 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 ENAMQ9NRM1 1142 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 GPR83Q9NYM4 423 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 VPS4AQ9UN37 437 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 PLCL2Q9UPR0 1127 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.22■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 ISM1B1AKI9 464 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SLCO2B1O94956 709 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 S1PR4O95977 384 aa20.21■□□□□ 0.83
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LIMS1-208ENST00000428064 CBSP35520 551 aa20.21■□□□□ 0.83
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LIMS1-208ENST00000428064 LINC01555Q8NAE3 123 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 OR2Y1Q8NGV0 311 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 C5AR2Q9P296 337 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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LIMS1-208ENST00000428064 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 AP3B1O00203 1094 aa20.2■□□□□ 0.82
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF185O15231 689 aa20.2■□□□□ 0.82
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LIMS1-208ENST00000428064 CD9P21926 228 aa20.2■□□□□ 0.82
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LIMS1-208ENST00000428064 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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LIMS1-208ENST00000428064 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 MPP5Q8N3R9 675 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 NACC2Q96BF6 587 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 TREX1Q9NSU2 369 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 NDOR1Q9UHB4 597 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PCM1Q15154 2024 aa20.19■□□□□ 0.82
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