RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF823P16415 610 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXN2P32314 431 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 NSG1P42857 185 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 EVX2Q03828 476 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MSANTD2Q6P1R3 559 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 USP43Q70EL4 1123 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TAC4Q86UU9 113 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GALNT13Q8IUC8 556 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PYROXD2Q8N2H3 581 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC54Q8NEL0 328 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2L3Q8NG85 312 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 POF1BQ8WVV4 589 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR20Q99678 358 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNS3Q9BQ31 491 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP26Q9BV47 211 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHAC1Q9H158 963 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 DAPL1A0PJW8 107 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM234BA2RU67 622 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 C8GP07360 202 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 OR3A3P47888 321 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 OR3A2P47893 321 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVK-8P63133 956 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.688e-6■■■□□ 18.9
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN18Q99952 460 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 KXD1Q9BQD3 176 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 EBF4Q9BQW3 602 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 DTLQ9NZJ0 730 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF639Q9UID6 485 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXW2Q9UKT8 454 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF13BQ9NQT8 1826 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PRORSD1PA6NEY8 169 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PLSCR1O15162 318 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 NOBOXO60393 691 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ECHS1P30084 290 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GJA8P48165 433 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CASP9P55211 416 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 IL10RBQ08334 325 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 DSC3Q14574 896 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TIGD6Q17RP2 521 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SLITRK4Q8IW52 837 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf216Q8TAB5 229 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP76Q8TAP6 659 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM110BQ8TC76 370 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TFAP2BQ92481 460 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 LMLNQ96KR4 655 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT46Q9NQC8 304 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CTPS2Q9NRF8 586 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 IGSF9Q9P2J2 1179 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MLXQ9UH92 298 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MSRAQ9UJ68 235 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MED31Q9Y3C7 131 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR25O00155 361 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 EPHX1P07099 455 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 FESP07332 822 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ALAS2P22557 587 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PLA2G16P53816 162 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SP3Q02447 781 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF460Q14592 562 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CRB2Q5IJ48 1285 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAG16Q8N0X2 631 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 OR6K6Q8NGW6 343 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 LCN9Q8WX39 176 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC35G5Q96KT7 338 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT27Q9BW83 186 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 NEMP2A6NFY4 417 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 FFAR2O15552 330 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TPST2O60704 377 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 HMGN1P05114 100 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 RORCP51449 518 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 NDST2P52849 883 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 JAM2P57087 298 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 VLDLRP98155 873 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CDKL1Q00532 357 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 IDNKQ5T6J7 187 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM198Q66K66 360 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MPP5Q8N3R9 675 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CANT1Q8WVQ1 401 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMK1GQ96NX5 476 aa10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ACBD6Q9BR61 282 aa10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms