RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 K7ENP7 123 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BTN3A1O00481 513 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RASGRF2O14827 1237 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAD1O60671 282 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STK17BO94768 372 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLGAP3O95886 979 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RECKO95980 971 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HBQ1P09105 142 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MPC1LP0DKB6 136 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MPSTP25325 297 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FMO4P31512 558 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ELK3P41970 407 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLCN7P51798 805 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXM1Q08050 763 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SP140Q13342 867 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BRD3Q15059 726 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKS6Q68DC2 871 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUPD1Q68J44 220 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C8orf74Q6P047 294 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAT14Q8WUY8 206 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDKL2Q92772 493 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INPP5DQ92835 1189 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCTN2Q96GX1 697 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR6C1Q96RD1 312 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ULBP3Q9BZM4 244 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPRY4Q9C004 299 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRORYQ9H606 182 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGF21Q9NSA1 209 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFATQ9P243 1243 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKMY1Q9P2S6 941 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCND3Q9UK17 655 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DHRS7Q9Y394 339 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLK4Q9Y5K2 254 aa8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCM1Q15154 2024 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MGAQ8IWI9 3026 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IQCF5A8MTL0 148 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C21orf140B9A014 251 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TK2O00142 265 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYO1CO00159 1063 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BTN3A3O00478 584 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAD51CO43502 376 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NIPSNAP2O75323 286 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCNDBP1O95273 360 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf105O95561 183 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITGB2P05107 769 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERGP11308 486 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITGB6P18564 788 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEPHS1P49903 392 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EMP3P54852 163 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MGAT5Q09328 741 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRKG2Q13237 762 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTBP1Q13363 440 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAB1Q13506 487 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RASGRP3Q8IV61 690 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR135Q8IZ08 494 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT222Q8N1A0 295 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF18AQ8NI77 898 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.29□□□□□ -1.08
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms