RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 CCT8P50990 548 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 HLA-BQ31612 363 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF678Q5SXM1 525 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 SFRP1Q8N474 314 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 MAPK15Q8TD08 544 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM237Q96Q45 408 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 HGH1Q9BTY7 390 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 YY2O15391 372 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 STK16O75716 305 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ALPPL2P10696 532 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CCND1P24385 295 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 NAGLUP54802 743 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 GYS2P54840 703 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 STX3Q13277 289 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CNDP1Q96KN2 507 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CD244Q9BZW8 370 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 GAREM1Q9H706 876 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 B4DGG1 531 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 EML2O95834 649 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC16A8O95907 504 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 IMPA1P29218 277 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 GNGT1P63211 74 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 AGTRAPQ6RW13 159 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 HOMEZQ8IX15 550 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 SYTL1Q8IYJ3 562 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 NAGSQ8N159 534 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CPNE7Q9UBL6 633 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 OPTCQ9UBM4 332 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM221BA6H8Z2 402 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 SDC3O75056 442 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 KATNA1O75449 491 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 SUPT7LO94864 414 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 MLYCDO95822 493 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 ERGP11308 486 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 SHMT2P34897 504 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC19A1P41440 591 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 RAB28P51157 221 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 PNLIPRP1P54315 467 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 RCN2Q14257 317 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 FRMD7Q6ZUT3 714 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 PRSS33Q8NF86 280 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 DRC3Q9H069 523 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 THAP1Q9NVV9 213 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 K7EPI3 171 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 TAPBPO15533 448 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC6A12P48065 614 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 HSPA7P48741 367 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 BST1Q10588 318 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 TCF15Q12870 199 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 PRKG2Q13237 762 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 BIRC2Q13490 618 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 GRB7Q14451 532 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 SHBQ15464 509 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 CYP2A13Q16696 494 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 OGFOD3Q6PK18 319 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 OR52E1Q8NGJ3 308 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF480Q8WV37 535 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC32A1Q9H598 525 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms