RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GRB14Q14449 540 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TRPV1Q8NER1 839 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NPLOC4Q8TAT6 608 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GAL3ST4Q96RP7 486 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GPER1Q99527 375 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MPIP34949 423 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CCR8P51685 355 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNA6Q15825 494 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 FRG2Q64ET8 278 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DLK2Q6UY11 383 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 OSTM1Q86WC4 334 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 FRG2BQ96QU4 278 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SMOQ99835 787 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJB4Q9UDY4 337 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.773e-7■□□□□ 11
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM44Q2T9K0 475 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SIX4Q9UIU6 781 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DLX3O60479 287 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PRKCGP05129 697 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R2BQ00005 443 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC13A2Q13183 592 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CNKSR3Q6P9H4 555 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC51AQ86UW1 340 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SIAH1Q8IUQ4 282 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MCEMP1Q8IX19 187 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CAMK1GQ96NX5 476 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 AKTIPQ9H8T0 292 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 COPS7AQ9UBW8 275 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 UBR1Q8IWV7 1749 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 AQP4P55087 323 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 IL18Q14116 193 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 EIPR1Q53HC9 387 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 KLK6Q92876 244 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ADAP2Q9NPF8 381 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ZIM2Q9NZV7 527 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GRK6P43250 576 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC32Q14392 662 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 FRRS1Q6ZNA5 592 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ABCB9Q9NP78 766 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CD320Q9NPF0 282 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GALPQ9UBC7 116 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 IL36AQ9UHA7 158 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DHRS7Q9Y394 339 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ACP5P13686 325 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3CBP42338 1070 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ASB9Q96DX5 294 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 RNF31Q96EP0 1072 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2S1Q96SQ9 504 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 FEM1AQ9BSK4 669 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 KCNN2Q9H2S1 579 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DSN1Q9H410 356 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SMURF2Q9HAU4 748 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 DGKBQ9Y6T7 804 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SCAMP1O15126 338 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 RLN1P04808 185 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 RB1P06400 928 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 JAG1P78504 1218 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 C5orf22Q49AR2 442 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 AHI1Q8N157 1196 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CDK15Q96Q40 435 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHAC1Q9H158 963 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf27AQ580R0 203 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 TPRG1Q6ZUI0 275 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 USP30Q70CQ3 517 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF461Q8TAF7 563 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF30P17039 623 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 HOXD13P35453 343 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GPX6P59796 221 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 FPGSQ05932 587 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GPM6BQ13491 265 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CGREF1Q99674 301 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 COPS4Q9BT78 406 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MOCS1Q9NZB8 636 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA7Q9P0W8 599 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 AVPR1BP47901 424 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF792Q3KQV3 632 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GLIS1Q8NBF1 620 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 GPR151Q8TDV0 419 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 FCGR1BQ92637 280 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC58Q96CX6 371 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 SLC29A3Q9BZD2 475 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 PRKAB1Q9Y478 270 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 ITM2AO43736 263 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-203ENST00000366687 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms