RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ATP6V1B2P21281 511 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 LHCGRP22888 699 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ACRV1P26436 265 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 IL2P60568 153 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 FOXM1Q08050 763 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 DUSP6Q16828 381 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GDPD4Q6W3E5 623 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 RBFAQ8N0V3 343 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GPR26Q8NDV2 337 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 TRPV3Q8NET8 790 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 FRS2Q8WU20 508 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CYGBQ8WWM9 190 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CLPBQ9H078 707 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF639Q9UID6 485 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CRLS1Q9UJA2 301 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 DHRS7Q9Y394 339 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PRSS21Q9Y6M0 314 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CHD7Q9P2D1 2997 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1W2PQ67 120 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 TTC34A8MYJ7 566 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CISD3P0C7P0 127 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ADH5P11766 374 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 WEE1P30291 646 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 VIPR2P41587 438 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 NRIP1P48552 1158 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 SLC7A2P52569 658 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PTPN5P54829 565 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PHKG1Q16816 387 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 EML3Q32P44 896 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CYBRD1Q53TN4 286 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO39Q8N4B4 442 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 MINDY1Q8N5J2 469 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 OSCP1Q8WVF1 389 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 VMP1Q96GC9 406 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 LRCH3Q96II8 777 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 BRD9Q9H8M2 597 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 NDUFAF1Q9Y375 327 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 SYCE1LA8MT33 242 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ABCB7O75027 752 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GPC4O75487 556 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PAPLNO95428 1278 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 C1SP09871 688 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PBX2P40425 430 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GSSP48637 474 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CDH13P55290 713 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PTSQ03393 145 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GPR33Q49SQ1 333 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 COQ5Q5HYK3 327 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 VN1R2Q8NFZ6 395 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ASIC4Q96FT7 647 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 B4GALT6Q9UBX8 382 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ERVK-11Q9UQG0 969 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA8CPA6NN73 597 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 MATN1P21941 496 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 RPL10P27635 214 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GSTM2P28161 218 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 RPS9P46781 194 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC73Q5JTD7 316 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 RFLNAQ6ZTI6 216 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 C12orf40Q86WS4 652 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D21Q8IYX1 336 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PARP8Q8N3A8 854 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1958Q8N8K9 716 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 C16orf96A6NNT2 1141 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 KLK8O60259 260 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PCYT1AP49585 367 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 DGKGP49619 791 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 STX1BP61266 288 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 NEDD8Q15843 81 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRG5Q8IZF4 528 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 NXPE1Q8N323 547 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ASB2Q96Q27 587 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CIPCQ9C0C6 399 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms