RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 SLC28A1O00337 649 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 NUAK1O60285 661 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 ERN1O75460 977 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 HMBSP08397 361 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 CTSHP09668 335 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 GNPDA1P46926 289 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 DAPP51397 102 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 CLCN7P51798 805 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 LAPTM4AQ15012 233 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF181Q2M3W8 571 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 KDM4DQ6B0I6 523 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TUBA3EQ6PEY2 450 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SBSNQ6UWP8 590 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 DEFB132Q7Z7B7 95 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 PLPP6Q8IY26 295 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 KIAA1958Q8N8K9 716 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SMIM14Q96QK8 99 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 MMP27Q9H306 513 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 ACTL7AQ9Y615 435 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 IQCF5A8MTL0 148 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 FFAR3O14843 346 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 PER2O15055 1255 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 GPR42O15529 346 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 FFAR2O15552 330 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TYMPP19971 482 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 GGT5P36269 586 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TGFBR1P36897 503 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TGFBR2P37173 567 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TUBA1BP68363 451 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 PHC1P78364 1004 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 HMGCS1Q01581 520 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TUSC3Q13454 348 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 GTF2H3Q13889 308 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 NDUFA5Q16718 116 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 CARD16Q5EG05 197 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 OR2T5Q6IEZ7 315 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TUBA1AQ71U36 451 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 CEP68Q76N32 757 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 OR2T29Q8NH02 315 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 PSKH2Q96QS6 385 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 DCSTAMPQ9H295 470 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SIAEQ9HAT2 523 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 IFT52Q9Y366 437 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 A0A0D9SEW6 157 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 OR2A25A4D2G3 310 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TAF4O00268 1085 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 RAD51BO15315 384 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SEC22BO75396 215 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 PAX3P23760 479 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 PTGER3P43115 390 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 PIK3CGP48736 1102 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 HSPA7P48741 367 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 GPR15P49685 360 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 CLK1P49759 484 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 GZMMP51124 257 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF404Q494X3 552 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SNX20Q7Z614 316 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 C10orf111Q8N326 155 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 MYEOVQ96EZ4 313 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 MARCH2Q9P0N8 246 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 MYO1GB0I1T2 1018 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 F8W810 466 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SNPHO15079 494 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 RFPL2O75678 378 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 PRLP01236 227 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 RGRP47804 291 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 POC5Q8NA72 575 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 LPCAT1Q8NF37 534 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 EXOC2Q96KP1 924 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 LRTM1Q9HBL6 345 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 ASIC5Q9NY37 505 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 TESMINQ9Y4I5 508 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa17.93■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 A8MU76 341 aa17.92■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 INSIG1O15503 277 aa17.92■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 ULK1O75385 1050 aa17.92■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF682O95780 498 aa17.92■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 DLGAP3O95886 979 aa17.92■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 LCKP06239 509 aa17.92■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 KRT20P35900 424 aa17.92■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 LRIF1Q5T3J3 769 aa17.92■□□□□ 0.46
LRRC25-201ENST00000339007 SUSD1Q6UWL2 747 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms