RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CA12O43570 354 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SLC13A3Q8WWT9 602 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFS4O43181 175 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 BDKRB1P46663 353 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 LCN1P1Q5VSP4 162 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ABHD13Q7L211 337 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ANXA2P2A6NMY6 339 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM150CB9EJG8 249 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PI15O43692 258 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH3A2P51648 485 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 SCARB2Q14108 478 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TXNDC8Q6A555 127 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 BICRALQ6AI39 1079 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 FZD8Q9H461 694 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0J9YVX5 310 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 SP140Q13342 867 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM145Q8NBT3 493 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PLGP00747 810 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TLE2Q04725 743 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 SIRPB2Q5JXA9 342 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 IQCKQ8N0W5 287 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF516Q92618 1163 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 HAPLN3Q96S86 360 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 RAB26Q9ULW5 256 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 LAPTM4BQ86VI4 370 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 DHRS1Q96LJ7 313 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 K7EPI3 171 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PGRP06401 933 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 HAVCR1Q96D42 359 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM2Q9C040 744 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 RNF39Q9H2S5 420 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 MALT1Q9UDY8 824 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 SNX7Q9UNH6 387 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PRB8 838 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 VBP1P61758 197 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 GPR68Q15743 365 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ROPN1LQ96C74 230 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 IRAK2O43187 625 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TULP3O75386 442 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 EIPR1Q53HC9 387 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM139Q8IV31 216 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ARVCFO00192 962 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ZZZ3Q8IYH5 903 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 IL1RAPQ9NPH3 570 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TNFP01375 233 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R50P59544 299 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 BTN3A2P78410 334 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 IDNKQ5T6J7 187 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TPGS2Q68CL5 300 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 J3KR12 359 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PPEF2O14830 753 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 MPZL2O60487 215 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PLGLB1Q02325 96 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ELOA3BQ3SY89 546 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZVU0 165 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ELOA3Q8NG57 546 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 HCAR2Q8TDS4 363 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 RPL10P27635 214 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ACVRL1P37023 503 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CHRNA6Q15825 494 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 DGAT2Q96PD7 388 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PEX2P28328 305 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 GPR153Q6NV75 609 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TOP1MTQ969P6 601 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PLAGL1Q9UM63 463 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PRDX6P30041 224 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 MPIP34949 423 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PDGFRLQ15198 375 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms