RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 MT-ND2P03891 347 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 VEGFBP49765 207 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ARSDP51689 593 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RING1Q06587 406 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 DGCR6Q14129 220 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ZFP69Q49AA0 526 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RBFAQ8N0V3 343 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 C8orf48Q96LL4 319 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 MBOAT4Q96T53 435 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TINF2Q9BSI4 451 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 IPPKQ9H8X2 491 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 Q9Y3F1 56 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PRR23AA6NEV1 266 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ANXA5P08758 320 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 HIST1H2ADP20671 130 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 HNF4AP41235 474 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 FOXA1P55317 472 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CDC42P60953 191 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TUSC3Q13454 348 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CEP78Q5JTW2 689 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PGBD3Q8N328 593 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 NEK6Q9HC98 313 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 GALPQ9UBC7 116 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 DHRS7Q9Y394 339 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SCN1AP35498 2009 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TRIP11Q15643 1979 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CACNA1GO43497 2377 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 C9JVG2 144 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 UPK1AO00322 258 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RFXANKO14593 260 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CBSLP0DN79 551 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PCMT1P22061 227 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CBSP35520 551 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 MAPK8P45983 427 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 FCGRTP55899 365 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CLDN8P56748 225 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 MAXP61244 160 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ADAM17P78536 824 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 AQP6Q13520 282 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 STARD3Q14849 445 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TIGD6Q17RP2 521 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 AGAP6Q5VW22 663 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 IL31Q6EBC2 164 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 NEK5Q6P3R8 708 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SERPINA11Q86U17 422 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms