RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 OR52E8Q6IFG1 317 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 LIX1Q8N485 282 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 NAT16Q8N8M0 369 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 MED8Q96G25 268 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 TOX2Q96NM4 488 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 HEPHQ9BQS7 1158 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 BOCQ9BWV1 1114 aa15.95■□□□□ 0.14
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CTCF-201ENST00000264010 ACSM2BQ68CK6 577 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 FUNDC1Q8IVP5 155 aa15.93■□□□□ 0.14
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CTCF-201ENST00000264010 HMG20AQ9NP66 347 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 STMN3Q9NZ72 180 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 TRIM24O15164 1050 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 TGM5O43548 720 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 SLC6A2P23975 617 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 MTPNP58546 118 aa15.93■□□□□ 0.14
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CTCF-201ENST00000264010 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 SDE2Q6IQ49 451 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 Q6ZVU0 165 aa15.93■□□□□ 0.14
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CTCF-201ENST00000264010 ITPKAP23677 461 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 CSNK1DP48730 415 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 NANOGP8Q6NSW7 305 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 FKBP9P1Q75LS8 142 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 ROGDIQ9GZN7 287 aa15.93■□□□□ 0.14
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