RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF160Q9HCG1 818 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 KCNN3Q9UGI6 736 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf74A8MZ97 194 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 GPR39O43194 453 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 WDPCPO95876 746 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 PRR35P0CG20 571 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SLC5A12Q1EHB4 618 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SPESP1Q6UW49 350 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM73Q86UV7 250 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 DNAAF3Q8N9W5 541 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 FAM71BQ8TC56 605 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 AGAP11Q8TF27 550 aa15.74■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 RNF32Q9H0A6 362 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 LIME1Q9H400 295 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ACTR10Q9NZ32 417 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CTSFQ9UBX1 484 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 NENFQ9UMX5 172 aa15.74■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 PRAMEF1O95521 474 aa15.73■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 C8BP07358 591 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CD48P09326 243 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 MEOX1P50221 254 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ARSEP51690 589 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 MMRN1Q13201 1228 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SIRT6Q8N6T7 355 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 VKORC1Q9BQB6 163 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 HAUS2Q9NVX0 235 aa15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087X0T9 212 aa15.72■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 MSX1P28360 303 aa15.72■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 FANCCQ00597 558 aa15.72■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.72■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 OR2L2Q8NH16 312 aa15.72■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CBX8Q9HC52 389 aa15.72■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF358Q9NW07 568 aa15.72■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 FAM8A1Q9UBU6 413 aa15.72■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.72■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.72■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SERPING1P05155 500 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 HEXAP06865 529 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ALAS2P22557 587 aa15.71■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 DSG2Q14126 1118 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 KRT33BQ14525 404 aa15.71■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.71■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 DLG3Q92796 817 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 C8orf44Q96CB5 159 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 C18orf12Q96KH6 178 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TSGA13Q96PP4 275 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 IL26Q9NPH9 171 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 OR5H15A6NDH6 313 aa15.7■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.7■□□□□ 0.1
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