RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 C5orf60A6NFR6 353 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC38A8A6NNN8 435 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 AGPSO00116 658 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAP2K7O14733 419 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 HCRTO43612 131 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMPRSS11DO60235 418 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 GCATO75600 419 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 GRAP2O75791 330 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM155BO75949 473 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 WDR47O94967 919 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 OLFM2O95897 454 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 KRT14P02533 472 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 FYNP06241 537 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 FESP07332 822 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 RHOP08100 348 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 ABHD2P08910 425 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 NUDT17P0C025 328 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYZAPP0CAP1 466 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 NR2F6P10588 404 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 MLNP12872 115 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 RARGP13631 454 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 CREB1P16220 341 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 NDUFB7P17568 137 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 TPSB2P20231 275 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCNCP24863 283 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 KLRC2P26717 231 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR1D2P34982 312 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 CTNNB1P35222 781 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 PHBP35232 272 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 GARSP41250 739 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 GRIA3P42263 894 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 NDST2P52849 883 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 COL10A1Q03692 680 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 GALNT2Q10471 571 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 TAF10Q12962 218 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 MTAPQ13126 283 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 NME3Q13232 169 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 NAB1Q13506 487 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 DPYSQ14117 519 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 CASP8Q14790 479 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 RASA2Q15283 850 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 E2F5Q15329 346 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 TPSAB1Q15661 275 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 PARP15Q460N3 678 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 C5orf22Q49AR2 442 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 KCNT1Q5JUK3 1230 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 MPP7Q5T2T1 576 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 HECTD3Q5T447 861 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF449Q6P9G9 518 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 CENPUQ71F23 418 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 CHST9Q7L1S5 443 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM131BQ86XD5 332 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDIK1LQ8N165 341 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 KRT222Q8N1A0 295 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 BBS5Q8N3I7 341 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLD5Q8N7P1 536 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 MCUQ8NE86 351 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLEC4CQ8WTT0 213 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 NSMCE1Q8WV22 266 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAPGEF5Q92565 580 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 BADQ92934 168 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 ART4Q93070 314 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 OTUB2Q96DC9 234 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 TBATAQ96M53 351 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 TSGA13Q96PP4 275 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 PEBP4Q96S96 227 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC77Q9BR77 488 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD39.4-201ENST00000620099 FUT8Q9BYC5 575 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms