RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RDH11	Q8TC12	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPT1B	Q92523	772 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PORCN	Q9H237	461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MGAM	O43451	1857 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A1W2PPM1	405 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MDM4	O15151	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OGT	O15294	1046 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CST8	O60676	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMCC1	O94876	653 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RASAL1	O95294	804 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFNB1	P01574	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TNNC2	P02585	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APOE	P02649	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERPINE1	P05121	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYL2	P10916	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VDR	P11473	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GM2A	P17900	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AKAP5	P24588	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADRA1D	P25100	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERPINB3	P29508	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARL2	P36404	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACADVL	P49748	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COPA	P53621	1224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AIF1	P55008	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAS2R40	P59535	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TFDP1	Q14186	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NFATC4	Q14934	902 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HERC3	Q15034	1050 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PGM5	Q15124	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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