RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 MCM3P25205 808 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CAPZBP47756 277 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL4DP49703 201 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CLCN7P51798 805 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PGGT1BP53609 377 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SH3BP2P78314 561 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MC2RQ01718 297 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXM1Q08050 763 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MGAT5Q09328 741 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CBLBQ13191 982 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CUL1Q13616 776 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KYNUQ16719 465 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PROSER1Q86XN7 944 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PPM1MQ96MI6 270 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FOPNLQ96NB1 174 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 IL17FQ96PD4 163 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TAAR9Q96RI9 348 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB33BQ9H082 229 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 APMAPQ9HDC9 416 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 THSD1Q9NS62 852 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFATQ9P243 1243 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 DKK4Q9UBT3 224 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ICKQ9UPZ9 632 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 VWA7Q9Y334 891 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CACNA1AO00555 2505 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS20P59510 1910 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PIPSLA2A3N6 862 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT87PA6NCN2 255 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf74A8MZ97 194 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf172C9J069 976 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM1AO60341 852 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MATN4O95460 622 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RPN2P04844 631 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGA2BP08514 1039 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PVRP15151 417 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ITPKBP27987 946 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SHMT2P34897 504 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 BDKRB1P46663 353 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CDKN2DP55273 166 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GPX6P59796 221 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GRB7Q14451 532 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GBX1Q14549 363 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNAB1Q14722 419 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TGIF1Q15583 401 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 DCAF12Q5T6F0 453 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKS6Q68DC2 871 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 BMPERQ8N8U9 685 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GPATCH11Q8N954 259 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms