RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC188	H7C350	402 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	IL18BP	O95998	194 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SOD1	P00441	154 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	IGHG3	P01860	377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	UQCRH	P07919	91 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TPM2	P07951	284 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DANCR	P0C864	163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ICAM2	P13598	275 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TIMP3	P35625	211 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PREP	P48147	710 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF136	P52737	540 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	EFNA3	P52797	238 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	EVC	P57679	992 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DPT	Q07507	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	AP1B1	Q10567	949 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MTA1	Q13330	715 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ACER2	Q5QJU3	275 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	HYI	Q5T013	277 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	C1orf189	Q5VU69	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	COX15	Q7KZN9	410 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF516	Q92618	1163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	COX14	Q96I36	57 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ITGA10	O75578	1167 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SLC25A12	O75746	678 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TGFA	P01135	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FYN	P06241	537 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CELA2A	P08217	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ASPA	P45381	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CCR8	P51685	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TERF1	P54274	439 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SLC8A3	P57103	927 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RAD51	Q06609	339 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TRPC3	Q13507	836 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GRM3	Q14832	879 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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