RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 TEKT4Q8WW24 435 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MAGED4Q96JG8 741 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 C12orf66Q96MD2 445 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR137Q96N19 417 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 VPS35Q96QK1 796 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 UCK2Q9BZX2 261 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 WDR54Q9H977 334 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 E9PLN8 166 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 BIN1O00499 593 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR39O43194 453 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PRPSAP2O60256 369 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 LY6G6DO95868 133 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 HPP00738 406 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CALB1P05937 261 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CELA2AP08217 269 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PIRTP0C851 137 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PRR35P0CG20 571 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 UCHL3P15374 230 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PCSK6P29122 969 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PRKAA1Q13131 559 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 RBBP7Q16576 425 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CES4AQ5XG92 561 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MAML1Q92585 1016 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 FKBP10Q96AY3 582 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 C8orf44Q96CB5 159 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF653Q96CK0 615 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 STK33Q9BYT3 514 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 DEF6Q9H4E7 631 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CTSFQ9UBX1 484 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2AG2A6NM03 316 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MATN2O00339 956 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 AURKAO14965 403 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PMPCBO75439 489 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CTAG2O75638 210 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZWINTO95229 277 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PRAMEF1O95521 474 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC4A1P02730 911 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ALBP02768 609 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PROCP04070 461 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 HLA-DQB2P05538 268 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MIPP30301 263 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 HSF1Q00613 529 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 GTF2H3Q13889 308 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 VWA3BQ502W6 1294 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TRIM73Q86UV7 250 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 NAT14Q8WUY8 206 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MBD6Q96DN6 1003 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TIGD1Q96MW7 591 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TRIB3Q96RU7 358 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TRIM7Q9C029 511 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF32Q9H0A6 362 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 NDST4Q9H3R1 872 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PPT2Q9UMR5 302 aa7.35□□□□□ -1.23
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