RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	TSPAN7	P41732	249 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MC2R	Q01718	297 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CTBP1	Q13363	440 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	VASH2	Q86V25	355 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KMT5C	Q86Y97	462 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	UBXN4	Q92575	508 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	C9orf72	Q96LT7	481 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CTRC	Q99895	268 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549		K7ENP7	123 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	BANF1	O75531	89 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ITGB6	P18564	788 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CD82	P27701	267 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SHMT2	P34897	504 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CCNF	P41002	786 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SEPHS1	P49903	392 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PLTP	P55058	493 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	RAB15	P59190	212 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PPP1CA	P62136	330 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MGAT5	Q09328	741 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	BRD3	Q15059	726 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PCSK4	Q6UW60	755 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PALM2	Q8IXS6	379 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB2	Q8N680	514 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	RNF31	Q96EP0	1072 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	FOPNL	Q96NB1	174 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	DHRS7	Q9Y394	339 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	VPS26A	O75436	327 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SPAG6	O75602	509 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	HAUS5	O94927	633 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MATN4	O95460	622 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CBSL	P0DN79	551 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CBS	P35520	551 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CLCN7	P51798	805 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SH3BP2	P78314	561 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MANEA	Q5SRI9	462 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	IRGC	Q6NXR0	463 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CNST	Q6PJW8	725 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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