RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557030.5

ATXN3-246, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 807 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-246ENST00000557030 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 WASHC5Q12768 1159 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 OVGP1Q12889 678 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 MED21Q13503 144 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 TFDP2Q14188 446 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 TAZQ16635 292 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 C10orf25Q5T742 122 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 C1orf146Q5VVC0 180 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ACSM6Q6P461 480 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 SLC39A4Q6P5W5 647 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 TMEM270Q6UE05 265 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 IZUMO2Q6UXV1 221 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 LCA5Q86VQ0 697 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF366Q8N895 744 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 CATSPER1Q8NEC5 780 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 MIPOL1Q8TD10 442 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 DTX3LQ8TDB6 740 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ITFG2Q969R8 447 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 OPTNQ96CV9 577 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 C12orf42Q96LP6 360 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 MCEEQ96PE7 176 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 FAM111AQ96PZ2 611 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 BTBD9Q96Q07 612 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 FAM213AQ9BRX8 229 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 NMUR2Q9GZQ4 415 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 Q9H521 79 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 KCNK13Q9HB14 408 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 RNF146Q9NTX7 359 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PAK5Q9P286 719 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 THEGQ9P2T0 379 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 SLC17A7Q9P2U7 560 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ATXN10Q9UBB4 475 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 BCAP29Q9UHQ4 241 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 TMCO1Q9UM00 188 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 DOCK1Q14185 1865 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF541Q9H0D2 1346 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 SSC5DA1L4H1 1573 aa4.7□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 TTC34A8MYJ7 566 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PRYO14603 147 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 DHHO43323 396 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 TMCC1O94876 653 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 APOC2P02655 101 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 IGKV2-30P06310 120 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ENO1P06733 434 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ITGA5P08648 1049 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PEPDP12955 493 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ETS1P14921 441 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 UQCRBP14927 111 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 DESP17661 470 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PSMA2P25787 234 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 NDUFS1P28331 727 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 DUSP1P28562 367 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 PRDX6P30041 224 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 CCND2P30279 289 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 SSTR1P30872 391 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 RPL22P35268 128 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 RGS2P41220 211 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ELK3P41970 407 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 HSPA13P48723 471 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 LBX1P52954 281 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ROR1Q01973 937 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF91Q05481 1191 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 FOXO1Q12778 655 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 CDC16Q13042 620 aa4.69□□□□□ -1.66
ATXN3-246ENST00000557030 STX3Q13277 289 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms