RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SMOX	Q9NWM0	555 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	POMT2	Q9UKY4	750 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PKP3	Q9Y446	797 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ESPL1	Q14674	2120 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	OR2AG2	A6NM03	316 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688		E7EVH7	732 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CCL22	O00626	93 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GPR39	O43194	453 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PHF2	O75151	1096 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	KRT14	P02533	472 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	HLA-DPA1	P20036	260 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	MSH3	P20585	1137 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ITGA3	P26006	1051 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GRIA1	P42261	906 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GLRB	P48167	497 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CTSC	P53634	463 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TMPRSS15	P98073	1019 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ABR	Q12979	859 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PRPSAP1	Q14558	356 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CCNG2	Q16589	344 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	KYNU	Q16719	465 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	LCN10	Q6JVE6	187 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CREG2	Q8IUH2	290 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GPR135	Q8IZ08	494 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GALNT16	Q8N428	558 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	OR2L2	Q8NH16	312 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	OR1L3	Q8NH93	324 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	MARVELD3	Q96A59	401 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PTER	Q96BW5	349 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FCRL5	Q96RD9	977 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	WWP1	Q9H0M0	922 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	IL17C	Q9P0M4	197 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FLNC	Q14315	2725 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GUH1	482 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	C5orf60	A6NFR6	353 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	C2orf74	A8MZ97	194 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ZNF749	O43361	778 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	UGT1A9	O60656	530 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	RALB	P11234	206 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	UGT1A6	P19224	532 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	UGT1A1	P22309	533 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	UGT1A4	P22310	534 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	AKT1	P31749	480 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	OTX2	P32243	289 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FOLR3	P41439	243 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GEM	P55040	296 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GPS1	Q13098	491 aa		6.63	□□□□□ -1.35

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