RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6ZTK2	550 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5R1	Q8NH85	324 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	BBS10	Q8TAM1	723 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	LPAR1	Q92633	364 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SPDL1	Q96EA4	605 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ERO1A	Q96HE7	468 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	MUS81	Q96NY9	551 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	CMKLR1	Q99788	373 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	RHCG	Q9UBD6	479 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	LIPT1	Q9Y234	373 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM86B1	E9PN63	330 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	HS3ST1	O14792	307 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC16A5	O15375	505 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB43	O43298	467 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	STX6	O43752	255 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10H2	O60403	315 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP1A2	P05177	515 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	SRC	P12931	536 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	TCF4	P15884	667 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGB8	P26012	769 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPN3	P26045	913 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC25C	P30307	473 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	ALDH3A2	P51648	485 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	NAGLU	P54802	743 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	CD81	P60033	236 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	AP1B1	Q10567	949 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	COASY	Q13057	564 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	PTGR1	Q14914	329 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	CTF1	Q16619	201 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	AMZ1	Q400G9	498 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB6C	Q53S08	254 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	ODF2	Q5BJF6	829 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	MANEA	Q5SRI9	462 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM219A	Q8IW50	185 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM199	Q8N511	208 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	EXD1	Q8NHP7	514 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	WASF1	Q92558	559 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	CABS1	Q96KC9	395 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	EGFL8	Q99944	293 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	MYNN	Q9NPC7	610 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF150	Q9ULK6	438 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	SLIT3	O75094	1523 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0G2JLW4	131 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PPQ1	181 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	hDV102S1	A0JD36	115 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2M5	A3KFT3	312 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS14	O43566	566 aa		3.95	□□□□□ -1.78

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