RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 COQ8AQ8NI60 647 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ASB9Q96DX5 294 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 IER2Q9BTL4 223 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TBCDQ9BTW9 1192 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FBXW11Q9UKB1 542 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 M0QYT0 321 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SYN3O14994 580 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINB7O75635 380 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RD3LP0DJH9 198 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FGFR1P11362 822 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ITGA3P26006 1051 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 MAGEA11P43364 429 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RPS9P46781 194 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CXCR3P49682 368 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GDF10P55107 478 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FADDQ13158 208 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ORC1Q13415 861 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 MAJINQ3KP22 176 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TTLL9Q3SXZ7 439 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GLB1LQ6UWU2 654 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SSX6Q7RTT6 188 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ELMOD1Q8N336 334 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 LINC00471Q8N535 108 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ZUFSPQ96AP4 578 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SUSD3Q96L08 255 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FBXO44Q9H4M3 255 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PTGESO14684 152 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ULK1O75385 1050 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CSF2P04141 144 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CD48P09326 243 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GALK2Q01415 458 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PTGR1Q14914 329 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RAB39AQ14964 217 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 NDUFAF6Q330K2 333 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 REEP1Q9H902 201 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 BIN3Q9NQY0 253 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PDE10AQ9Y233 779 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 APOC1P02654 83 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 C9P02748 559 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FCER2P06734 321 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 NCK1P16333 377 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GCAP28676 217 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 MNDAP41218 407 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SLC15A1P46059 708 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 HSD17B7P56937 341 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 MXD1Q05195 221 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CDKL4Q5MAI5 379 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TPRG1LQ5T0D9 272 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CCNJQ5T5M9 372 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 WSCD1Q658N2 575 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FAM171BQ6P995 826 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CASP12Q6UXS9 341 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RADILQ96JH8 1075 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINB11Q96P15 392 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RASSF1Q9NS23 344 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 EP400Q96L91 3159 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 OR6C75A6NL08 312 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 EFCAB9A8MZ26 197 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RAB4AP20338 218 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ALAS2P22557 587 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FEN1P39748 380 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CREMQ03060 361 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms