RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 D6RAR5 112 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CASC3O15234 703 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ZBTB14O43829 449 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 NUDT17P0C025 328 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TPBGLP0DKB5 382 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SHMT2P34897 504 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC26A3P40879 764 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CAPZBP47756 277 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CSRP3P50461 194 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CFHR1Q03591 330 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SP140Q13342 867 aa15.98■□□□□ 0.15
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PACSIN3-210ENST00000533686 HES3Q5TGS1 186 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM71Q6P5X7 295 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 USP53Q70EK8 1073 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 OR4D9Q8NGE8 314 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ISL2Q96A47 359 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC12A9Q9BXP2 914 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PDP2Q9P2J9 529 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 OR5K3A6NET4 321 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGEF33A8MVX0 844 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MYO1CO00159 1063 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MATN2O00339 956 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 KRT37O76014 449 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SHBGP04278 402 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TYRP1P17643 537 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 BDKRB1P46663 353 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SERPINB8P50452 374 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB28P51157 221 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 BMPR2Q13873 1038 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RASA2Q15283 850 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CMC1Q7Z7K0 106 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 OOSP2Q86WS3 158 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TDRPQ86YL5 185 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 OR9A1PQ8NGU1 263 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKRD49Q8WVL7 239 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 NCSTNQ92542 709 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RSC1A1Q92681 617 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MTBPQ96DY7 904 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM74Q96NL1 305 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 DEPDC7Q96QD5 511 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 NUDT22Q9BRQ3 303 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MENTQ9BUN1 341 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 DERL2Q9GZP9 239 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RDH14Q9HBH5 336 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 HRASLS2Q9NWW9 162 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 OR6C2Q9NZP2 312 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ICKQ9UPZ9 632 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CLCA2Q9UQC9 943 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 DCHS1Q96JQ0 3298 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC151A5D8V7 595 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 OR6C74A6NCV1 312 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RASGRF2O14827 1237 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ERLIN1O75477 346 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 C9P02748 559 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CYP2A7P20853 494 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TYK2P29597 1187 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PKLRP30613 574 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CSF2RBP32927 897 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 HSD17B2P37059 387 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MAGEA12P43365 314 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ATP6V0D1P61421 351 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RAPH1Q70E73 1250 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SLITRK4Q8IW52 837 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB42Q8N4Z0 105 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 DLG3Q92796 817 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.96■□□□□ 0.15
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