RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 FAM60AQ9NP50 221 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CCDC175P0C221 793 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 UGT2B7P16662 529 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CACNG1Q06432 222 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 KYNUQ16719 465 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PARP6Q2NL67 630 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 C1orf189Q5VU69 101 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 MLIPQ5VWP3 458 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 KCTD11Q693B1 232 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 SLC6A19Q695T7 634 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 Q8NA96 180 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 SGSM3Q96HU1 749 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 DESI2Q9BSY9 194 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ASF1AQ9Y294 204 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 SEMA7AO75326 666 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 OR2B3O76000 313 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 AP2A2O94973 939 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 METTL18O95568 372 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 GSTM1P09488 218 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CBSLP0DN79 551 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CBSP35520 551 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 GSTM4Q03013 218 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 STYXQ8WUJ0 223 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ELMO1Q92556 727 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 FER1L5A0AVI2 2057 aa22.08■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 HCRTR1O43613 425 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 SHMT2P34897 504 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 ZIC1Q15915 447 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 NAPRTQ6XQN6 538 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 MRGPREQ86SM8 312 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 HPS6Q86YV9 775 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 TCTN2Q96GX1 697 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 OR2A14Q96R47 310 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 OR51F1A6NGY5 319 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 ZSCAN12O43309 604 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 NSG1P42857 185 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 PNPLA2Q96AD5 504 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 C17orf62Q9BQA9 187 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 CASS4Q9NQ75 786 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 FTH1P02794 183 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 CTSBP07858 339 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 RNF224P0DH78 156 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 ACADLP28330 430 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 FOLR3P41439 243 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 GABRA4P48169 554 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 SLC9A5Q14940 896 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 SYTL3Q4VX76 610 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 LURAP1LQ8IV03 231 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 POLG2Q9UHN1 485 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 A0A0J9YY10 115 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 H3BMH7 237 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 QSOX1O00391 747 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 KRT86O43790 486 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 TPBGLP0DKB5 382 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 GDF10P55107 478 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-210ENST00000533249 DCDP81605 110 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms