RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515062.5

SEC31A-240, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, human

TSL 3

Gene SEC31A, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEC31A-240	ENST00000515062	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	PRDM1	O75626	825 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	FGB	P02675	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	EPOR	P19235	508 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	KCNJ4	P48050	445 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	MMP15	P51511	669 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	GPC3	P51654	580 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	MTCP1	P56278	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	DPT	Q07507	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	HNF4G	Q14541	408 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	NPTX1	Q15818	432 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	KLC3	Q6P597	504 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062		Q6ZTK2	550 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	NUDT13	Q86X67	352 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	GLCE	O94923	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	BMP10	O95393	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	SLC4A1	P02730	911 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	ALPP	P05187	535 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	ALPPL2	P10696	532 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	PTGER4	P35408	488 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	NPBWR1	P48145	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	RFX2	P48378	723 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	PTH2R	P49190	550 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	CASP9	P55211	416 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	HTD2	P86397	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	TRAF2	Q12933	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	GAMT	Q14353	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	INA	Q16352	499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	KRT23	Q9C075	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC31A-240	ENST00000515062	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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