RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.63■□□□□ 0.57
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SH3BP2-220ENST00000511663 ICKQ9UPZ9 632 aa18.63■□□□□ 0.57
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SH3BP2-220ENST00000511663 ISM1B1AKI9 464 aa18.62■□□□□ 0.57
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC29A3Q9BZD2 475 aa18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC35B2Q8TB61 432 aa18.6■□□□□ 0.57
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SH3BP2-220ENST00000511663 AFTPHQ6ULP2 937 aa18.59■□□□□ 0.57
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SH3BP2-220ENST00000511663 HDAC10Q969S8 669 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP2-220ENST00000511663 PNPLA2Q96AD5 504 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP2-220ENST00000511663 PTERQ96BW5 349 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP2-220ENST00000511663 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
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