RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PIK3C2GO75747 1445 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 OVOS2Q6IE36 1432 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 NRKQ7Z2Y5 1582 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC37A3O60309 1634 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MON2Q7Z3U7 1717 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DLEC1Q9Y238 1755 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SYCE3A1L190 88 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RGSL1A5PLK6 1076 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KIR2DS3K7RE56 304 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RRHO14718 337 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CLDN3O15551 220 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 VEGFDO43915 354 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SSX4O60224 188 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PEX11AO75192 247 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FGBP02675 491 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 INHBAP08476 426 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DCTDP32321 178 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PSMC4P43686 418 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CTSCP53634 463 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC20A2Q08357 652 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DLG2Q15700 870 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DECR1Q16698 335 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SYT16Q17RD7 645 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TSTD2Q5T7W7 516 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 LINGO4Q6UY18 593 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MTSS1LQ765P7 747 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CAMK1DQ8IU85 385 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 C1orf210Q8IVY1 113 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA6LQ8N4H0 392 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PARP16Q8N5Y8 322 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC24A4Q8NFF2 622 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 THAP6Q8TBB0 222 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 URGCPQ8TCY9 931 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC8CQ8TDW0 803 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CKAP2Q8WWK9 683 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 IP6K1Q92551 441 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TAAR8Q969N4 342 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SSX3Q99909 188 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PIMREGQ9BSJ6 248 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CACNG6Q9BXT2 260 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FAM129AQ9BZQ8 928 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 NAPBQ9H115 298 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM245Q9H330 911 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RIBC2Q9H4K1 309 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SRD5A3Q9H8P0 318 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MAGEF1Q9HAY2 307 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D7Q9P0N9 293 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 U3KQV3 271 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 UBE4BO95155 1302 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 COL18A1P39060 1754 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KAT6AQ92794 2004 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SSH2Q76I76 1423 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ACEP12821 1306 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FAM205AQ6ZU69 1335 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PPM1 405 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CXorf65A6NEN9 183 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM221A6NGB7 291 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP42A6NI28 874 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC169A6NNP5 214 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 F8W810 466 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 M0QZ24 198 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 VCYO14598 125 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 BUD23O43709 281 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC25A17O43808 307 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TOMM70O94826 608 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 OR2T7P0C7T2 308 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 EBLN1P0CF75 366 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KRT13P13646 458 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 AREGP15514 252 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 UGT1A1P22309 533 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 AHCYP23526 432 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJB1P25685 340 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 IL15P40933 162 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TRPC1P48995 793 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RASSF2P50749 326 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ZXDAP98168 799 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MZT1Q08AG7 82 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL30Q0D2K2 578 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SCGB2A2Q13296 93 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PDK1Q15118 436 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HFEQ30201 348 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms