RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 LHX3Q9UBR4 397 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL36AQ9UHA7 158 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO5Q9UKT4 447 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PSMD13Q9UNM6 376 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDH23Q9H251 3354 aa5.5□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DENND4AQ7Z401 1863 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 LOC730098B7Z3J9 87 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRRT4C9JH25 899 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM38O00635 465 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SDHDO14521 159 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MUSKO15146 869 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PFDN6O15212 129 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 STX7O15400 261 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SOCS5O75159 536 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 UGT2B4P06133 528 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASGR2P07307 311 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MMP2P08253 660 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBP1P09455 135 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL9P15248 144 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TFEBP19484 476 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CR2P20023 1033 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 HOXA5P20719 270 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ME2P23368 584 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PEX2P28328 305 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 EPHA3P29320 983 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 NTSR1P30989 418 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PEX19P40855 299 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC1A2P43004 574 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCR10P46092 362 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 RGRP47804 291 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SOX9P48436 509 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAS2R39P59534 338 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DLG1Q12959 904 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CTBP1Q13363 440 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ART3Q13508 389 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PEX6Q13608 980 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGEF7Q14155 803 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GALNT3Q14435 633 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF234Q14588 700 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF460Q14592 562 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2orf27AQ580R0 203 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SFT2D3Q587I9 215 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TECRLQ5HYJ1 363 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF220Q5VTB9 566 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM215Q68D42 235 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC6A19Q695T7 634 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF470Q6ECI4 717 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEPROQ6NW34 567 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERAP2Q6P179 960 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLC3Q6P597 504 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 BRAT1Q6PJG6 821 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 KDELC1Q6UW63 502 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GALNT7Q86SF2 657 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM126BQ8IUX1 230 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP97Q8IW35 865 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DENND6AQ8IWF6 608 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DSELQ8IZU8 1212 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PGAM4Q8N0Y7 254 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ICA1LQ8NDH6 482 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIPK4Q8NE63 616 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMIEQ8NEW7 156 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR6K2Q8NGY2 324 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP70Q8NHQ1 597 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 BRSK1Q8TDC3 778 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 HCAR2Q8TDS4 363 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GANCQ8TET4 914 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DLG3Q92796 817 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 RCN3Q96D15 328 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC120Q96HB5 630 aa5.49□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms