RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SEMA6CQ9H3T2 930 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RDH14Q9HBH5 336 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 HRASLS2Q9NWW9 162 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TAS2R13Q9NYV9 303 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZFATQ9P243 1243 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MAP10Q9P2G4 905 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ASF1AQ9Y294 204 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 VWA7Q9Y334 891 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GON4LQ3T8J9 2241 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MYLKQ15746 1914 aa5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 OR6C74A6NCV1 312 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM8BA6NDV4 472 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 OR5K3A6NET4 321 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GFYI3L273 518 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PLD2O14939 933 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MAN1A2O60476 641 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 VPS26AO75436 327 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 F7P08709 466 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TYRP1P17643 537 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FDXRP22570 491 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 STX2P32856 288 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SHMT2P34897 504 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CCNFP41002 786 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CAPZBP47756 277 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CDKN2DP55273 166 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PRKG2Q13237 762 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 NAB1Q13506 487 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GRB7Q14451 532 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SLMAPQ14BN4 828 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PLCL1Q15111 1095 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ACSBG2Q5FVE4 666 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GRTP1Q5TC63 336 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PRSS42Q7Z5A4 293 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC25Q86WR0 208 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 OOSP2Q86WS3 158 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KMT5CQ86Y97 462 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FBXO39Q8N4B4 442 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 AGBL5Q8NDL9 886 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 OR4E2Q8NGC2 313 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GIMAP7Q8NHV1 300 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CD200R1Q8TD46 325 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FBF1Q8TES7 1133 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 LCN9Q8WX39 176 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ASB11Q8WXH4 323 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 IFT81Q8WYA0 676 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ANKRD7Q92527 254 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 UBXN4Q92575 508 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RSC1A1Q92681 617 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 NXPE2Q96DL1 559 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FOPNLQ96NB1 174 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CD180Q99467 661 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GPR21Q99679 349 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SRMSQ9H3Y6 488 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RHOJQ9H4E5 214 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 POPDC3Q9HBV1 291 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 OR6C2Q9NZP2 312 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM9Q9P0T7 183 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SATB2Q9UPW6 733 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ICKQ9UPZ9 632 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PSAT1Q9Y617 370 aa5.22□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FAM186AA6NE01 2351 aa5.21□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF292O60281 2723 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms