RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	SELPLG	Q14242	412 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TGFBI	Q15582	683 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIP10	Q15642	601 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	GAB4	Q2WGN9	574 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	MYLK3	Q32MK0	819 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	GPSM1	Q86YR5	675 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	VRK3	Q8IV63	474 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	JADE3	Q92613	823 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNJ9	Q92806	393 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	LYSMD1	Q96S90	227 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC29A1	Q99808	456 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	HGH1	Q9BTY7	390 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf50	Q9BV19	199 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ASB8	Q9H765	288 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	AIG1	Q9NVV5	245 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ADA2	Q9NZK5	511 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	CD274	Q9NZQ7	290 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	HACD3	Q9P035	362 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	SUN2	Q9UH99	717 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	CROT	Q9UKG9	612 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	COL4A3	Q01955	1670 aa		5.69	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	C5orf42	Q9H799	3197 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF839	A8K0R7	811 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	PRRT4	C9JH25	899 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	PEX1	O43933	1283 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM16	O95361	564 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	MATN4	O95460	622 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	APOD	P05090	189 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	PYGL	P06737	847 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	CAPN1	P07384	714 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	CTSL	P07711	333 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	SMIM18	P0DKX4	95 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	UQCRB	P14927	111 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	DRD1	P21728	446 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	PAX7	P23759	505 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC6A2	P23975	617 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ACRV1	P26436	265 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	CCR7	P32248	378 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	WAS	P42768	502 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	HSPA7	P48741	367 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TTPA	P49638	278 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	ACADVL	P49748	655 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC7A2	P52569	658 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	IL2	P60568	153 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	BCL2L1	Q07817	233 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	NFATC2	Q13469	925 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	FLOT2	Q14254	428 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	GBX1	Q14549	363 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA0040	Q15053	153 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	RBBP7	Q16576	425 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	GEN1	Q17RS7	908 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	RABL3	Q5HYI8	236 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF220	Q5VTB9	566 aa		5.68	□□□□□ -1.5
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC66	Q68CR7	880 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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