RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADI1Q9BV57 179 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPK1Q9H3S4 243 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNPLA3Q9NST1 481 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0C4DFX4 3053 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYCE1LA8MT33 242 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H3BNH8 94 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUOXP51687 545 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4D2P58180 307 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC7A9P82251 487 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CACNG1Q06432 222 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VRK3Q8IV63 474 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRG5Q8IZF4 528 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASB2Q96Q27 587 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAUS8Q9BT25 410 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM15Q9C019 465 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATAD3AQ9NVI7 634 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INSL6Q9Y581 213 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PP18 115 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA0355O15063 1070 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ESRRBO95718 433 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINA4P29622 427 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SELPLGQ14242 412 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARSIQ5FYB1 569 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NANOGP8Q6NSW7 305 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZVL8 140 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALNT7Q86SF2 657 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC22A15Q8IZD6 547 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIX5Q8N196 739 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR56A4Q8NGH8 313 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLHC1Q8NHS4 586 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STON2Q8WXE9 905 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSPRY1Q96DX4 576 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OSBPL10Q9BXB5 764 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NANOGQ9H9S0 305 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THEGQ9P2T0 379 aa15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUCA1P04066 466 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 G6PDP11413 515 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ETV3P41162 512 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP4BP51164 291 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP6V0D1P61421 351 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF7Q14155 803 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PYCR3Q53H96 274 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C6orf136Q5SQH8 315 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 P2RY12Q9H244 342 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPB41L1Q9H4G0 881 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BRD9Q9H8M2 597 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRGBPQ9NV56 204 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLOCKO15516 846 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBFA2T3O75081 653 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LEFTY1O75610 366 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNAP29O95721 258 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKT1P31749 480 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP3CCP48454 512 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP1S1P61966 158 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4GALNT1Q00973 533 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMGCS1Q01581 520 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP4R4Q6NUP7 873 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SBSNQ6UWP8 590 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRF7Q92985 503 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEE1Q9HCI5 957 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AIG1Q9NVV5 245 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACTR3BQ9P1U1 418 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM202A6NGA9 273 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CA3P07451 260 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UROSP10746 265 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BMPR1AP36894 532 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTGER3P43115 390 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FPGSQ05932 587 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MERTKQ12866 999 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms