RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487481.1

NME1-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 1, humanhuman

TSL 2

Gene NME1, Length 987 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-208ENST00000487481 TRIM73Q86UV7 250 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 CEP97Q8IW35 865 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 DLG3Q92796 817 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SPSB2Q99619 263 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 NRTNQ99748 197 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 GLOD4Q9HC38 313 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 ABI3Q9P2A4 366 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 FBN3Q75N90 2809 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 C19orf84I3L1E1 186 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SGTAO43765 313 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 KLHL18O94889 574 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 PRAMEF1O95521 474 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 ONECUT2O95948 504 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 CTSBP07858 339 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 PRLHRP49683 370 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 TNFSF10P50591 281 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 TLE4Q04727 773 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 Q0VFX4 171 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 RBBP7Q16576 425 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 NKG7Q16617 165 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 ZNF398Q8TD17 642 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 NAT14Q8WUY8 206 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 HGH1Q9BTY7 390 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 THAP2Q9H0W7 228 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 A0A1B0GX78 115 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 HAX1O00165 279 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 CLDN14O95500 239 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 EPOP01588 193 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 UGT2B7P16662 529 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 ITGAXP20702 1163 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 ALAS2P22557 587 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 GCGRP47871 477 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 CD151P48509 253 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 TMPRSS15P98073 1019 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 PDK1Q15118 436 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 PLD5Q8N7P1 536 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 RNF157Q96PX1 679 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 XKR8Q9H6D3 395 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 COG4Q9H9E3 785 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 UBP1Q9NZI7 540 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 A0A0J9YY10 115 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SLC19A2O60779 497 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 USP1O94782 785 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 HPP00738 406 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 CYP1A2P05177 515 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 RALBP11234 206 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 MST1P26927 711 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SHMT2P34897 504 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 KIR3DL1P43629 444 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 ARSFP54793 590 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 WNT3AP56704 352 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 MYL5Q02045 173 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 TEX44Q53QW1 395 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 COX15Q7KZN9 410 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 OLFM3Q96PB7 478 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 OR2A14Q96R47 310 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 ICKQ9UPZ9 632 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 FANCGO15287 622 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 RASAL1O95294 804 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 FDXRP22570 491 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 SOX11P35716 441 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 CHRNA4P43681 627 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 PRKG2Q13237 762 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-208ENST00000487481 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms