RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 GSAPA4D1B5 854 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 GABRB3P28472 473 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SHMT2P34897 504 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CLCN7P51798 805 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 FOXM1Q08050 763 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 KYNUQ16719 465 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CNSTQ6PJW8 725 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CARFQ8N187 725 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 D2HGDHQ8N465 521 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB2Q8N680 514 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CERS2Q96G23 380 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SLC30A3Q99726 388 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ZPBPQ9BS86 351 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 NFS1Q9Y697 457 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS20P59510 1910 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 E5RI56 91 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 STMND1H3BQB6 276 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 FOLR1P15328 257 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 KCNAB1Q14722 419 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ9Q92806 393 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 OR6C1Q96RD1 312 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 MENTQ9BUN1 341 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 LHX6Q9UPM6 363 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SDK2Q58EX2 2172 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 C2orf74A8MZ97 194 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 RPN2P04844 631 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 FGF5P12034 268 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CDH3P22223 829 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ATP5DP30049 168 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PKLRP30613 574 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 HSD11B2P80365 405 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CALCOCO2Q13137 446 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 IL11RAQ14626 422 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 BROXQ5VW32 411 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ZNF592Q92610 1267 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PRORYQ9H606 182 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PILRAQ9UKJ1 303 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 BTRCQ9Y297 605 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PIPSLA2A3N6 862 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 KDM1AO60341 852 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 MATN4O95460 622 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 C1orf105O95561 183 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 AHSGP02765 367 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 TUBB4AP04350 444 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 EBLN1P0CF75 366 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 BDKRB1P46663 353 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ARL4DP49703 201 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 TRADDQ15628 312 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SPESP1Q6UW49 350 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 NKD1Q969G9 470 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 IL17FQ96PD4 163 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 OR2A14Q96R47 310 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 EFSO43281 561 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 DLGAP3O95886 979 aa20.27■□□□□ 0.84
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