RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479023.5

FGD4-205, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 4

Gene FGD4, Length 535 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-205	ENST00000479023	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023		E9PBE3	544 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023		H0YIN7	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TAF4	O00268	1085 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	SMIM24	O75264	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ATP5H	O75947	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ASNS	P08243	561 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CLTA	P09496	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CALM1	P0DP23	149 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CALM2	P0DP24	149 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CALM3	P0DP25	149 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	NR2F1	P10589	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TFPI	P10646	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	RALA	P11233	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	RARG	P13631	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	KRT5	P13647	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ANPEP	P15144	967 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	NFKBIA	P25963	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	NNMT	P40261	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	WNT5A	P41221	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	NT5C2	P49902	561 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CCR3	P51677	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TLE2	Q04725	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	RCN2	Q14257	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	DMC1	Q14565	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	UGP2	Q16851	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	CES5A	Q6NT32	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	STARD8	Q92502	1023 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	HTRA1	Q92743	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	IL25	Q9H293	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-205	ENST00000479023	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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