RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	KRT79	Q5XKE5	535 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	METTL7B	Q6UX53	244 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LINC00523	Q86TU6	105 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GPR180	Q86V85	440 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CNGA4	Q8IV77	575 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SVOP	Q8N4V2	548 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OCC1	Q8TAD7	63 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	REPS1	Q96D71	796 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MISP3	Q96FF7	219 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C4orf36	Q96KX1	117 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRRC1	Q96M27	445 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MBOAT7	Q96N66	472 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GPR88	Q9GZN0	384 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MIS12	Q9H081	205 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CHST8	Q9H2A9	424 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	IPPK	Q9H8X2	491 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CALHM2	Q9HA72	323 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TLR9	Q9NR96	1032 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SRRD	Q9UH36	339 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NAGK	Q9UJ70	344 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SNX7	Q9UNH6	387 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		A0A0J9YYE9	177 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1W2PPV4	95 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1W2PRG0	241 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PLSCR5	A0PG75	271 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MEGF11	A6BM72	1044 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF98	A6NK75	572 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	WWP2	O00308	870 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LAD1	O00515	517 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RNF13	O43567	381 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ADAP1	O75689	374 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRSS23	O95084	383 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TRBC1	P01850	177 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MMP3	P08254	477 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CELA3B	P08861	270 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	HBQ1	P09105	142 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GSTA2	P09210	222 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	STAG3L1	P0CL83	205 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC2A3	P11169	496 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TYR	P14679	529 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CNR1	P21554	472 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	AMPD1	P23109	780 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DGKA	P23743	735 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SERPINA4	P29622	427 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	EPHX2	P34913	555 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLCO1A2	P46721	670 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CDH4	P55283	916 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	BDH1	Q02338	343 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ACSM1	Q08AH1	577 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC13A2	Q13183	592 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NR0B2	Q15466	257 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CA9	Q16790	459 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NRN1L	Q496H8	165 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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