RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.77■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ARPC2O15144 300 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 SEC22BO75396 215 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 NFATC1O95644 943 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PRNPP04156 253 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 CA3P07451 260 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 HSPA13P48723 471 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 GGTA1PQ4G0N0 100 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 NANOGP8Q6NSW7 305 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 HID1Q8IV36 788 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 NRSN1Q8IZ57 195 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 BPIFB1Q8TDL5 484 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 GLYATL1Q969I3 302 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 NXPE3Q969Y0 559 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 AP2M1Q96CW1 435 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 NANOGQ9H9S0 305 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ASIC5Q9NY37 505 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 DHRS12A0PJE2 317 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PSMD11O00231 422 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 SLCO2B1O94956 709 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 GRIN2CQ14957 1233 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PDK3Q15120 406 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 SYTL3Q4VX76 610 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 FBXL19Q6PCT2 694 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 IFNEQ86WN2 208 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 C1orf109Q9NX04 203 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PDP2Q9P2J9 529 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 SNX6Q9UNH7 406 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ITM2BQ9Y287 266 aa16.76■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 GRXCR1A8MXD5 290 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PRRT4C9JH25 899 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 WNT9AO14904 365 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 DGKQP52824 942 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PTGR1Q14914 329 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 OR52E8Q6IFG1 317 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 LIX1Q8N485 282 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 GALNT4Q8N4A0 578 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PYCR2Q96C36 320 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM74Q96NL1 305 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 DPY30Q9C005 99 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJC11Q9NVH1 559 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 CHD7Q9P2D1 2997 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ATG13O75143 517 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 TIPRLO75663 272 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PDYNP01213 254 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 GSTM1P09488 218 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 SLC6A11P48066 632 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 GSTM4Q03013 218 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA0040Q15053 153 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 NEK5Q6P3R8 708 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 DLEU7Q6UYE1 221 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 NPAS3Q8IXF0 933 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 SELENOMQ8WWX9 145 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 SAMD11Q96NU1 681 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ACPTQ9BZG2 426 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 ELOVL6Q9H5J4 265 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 DEC1Q9P2X7 70 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 AURKCQ9UQB9 309 aa16.75■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 AKAP10O43572 662 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 TSPAN6O43657 245 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 IL10P22301 178 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 MESP2Q0VG99 397 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 PWP1Q13610 501 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 AAK1Q2M2I8 961 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 MTX3Q5HYI7 312 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 TBCELQ5QJ74 424 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 MARVELD2Q8N4S9 558 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.74■□□□□ 0.27
FAAP20-211ENST00000469733 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms