RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINI1Q99574 410 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HDAC8Q9BY41 377 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PBX4Q9BYU1 374 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 S1PR5Q9H228 398 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 IPPKQ9H8X2 491 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PARVBQ9HBI1 364 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SPAG4Q9NPE6 437 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TOR4AQ9NXH8 423 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC167Q9P0B6 97 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CD84Q9UIB8 345 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CROTQ9UKG9 612 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD13Q9UNM6 376 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ITM2BQ9Y287 266 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFAF1Q9Y375 327 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 F5P12259 2224 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MYO9BQ13459 2157 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 LOC730098B7Z3J9 87 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 K7ESM1 405 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 QSOX1O00391 747 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KPNA5O15131 536 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NPPAP01160 153 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FTH1P02794 183 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PRNPP04156 253 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ADRB3P13945 408 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CD22P20273 847 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V1B2P21281 511 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PEX2P28328 305 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TEAD1P28347 426 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DRD3P35462 400 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CASP2P42575 452 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PIK3CGP48736 1102 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HNMTP50135 292 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A2P52569 658 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 C21orf58P58505 322 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R38P59533 333 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PFN3P60673 137 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 STX1BP61266 288 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 UFM1P61960 85 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RHDQ02161 417 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF33BQ06732 778 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF7Q14155 803 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRE1Q14246 886 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FLOT2Q14254 428 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TAF11Q15544 211 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RBBP7Q16576 425 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 VPS26BQ4G0F5 336 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 LCE3BQ5TA77 95 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PRMT9Q6P2P2 845 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CYP20A1Q6UW02 462 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SCIMPQ6UWF3 145 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FRA10AC1Q70Z53 315 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF547Q8IVP9 402 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DDIASQ8IXT1 998 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A15Q8IZD6 547 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF366Q8N895 744 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 METTL6Q8TCB7 284 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GATA6Q92908 595 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC58Q96CX6 371 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SPDL1Q96EA4 605 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 WDR34Q96EX3 536 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 COX14Q96I36 57 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM74Q96NL1 305 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MYADMQ96S97 322 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SPSB2Q99619 263 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ECSITQ9BQ95 431 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.51□□□□□ -1.53
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