RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453923.1

DDX39BP2-208, Transcript of DEAD-box helicase 39B pseudogene 2, human

BASIC

Gene DDX39BP2, Length 258 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	EID2B	Q96D98	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923		E7ENQ6	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923		F8W810	466 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PPP6C	O00743	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PRY	O14603	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NCAM2	O15394	837 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IRAK2	O43187	625 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	APOE	P02649	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	UROD	P06132	367 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CD48	P09326	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RARG	P13631	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	KLRC2	P26717	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	YWHAQ	P27348	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NDUFS1	P28331	727 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CCR1	P32246	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GLUD2	P49448	558 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CXCR3	P49682	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	VPS41	P49754	854 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ARPP19	P56211	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TPI1	P60174	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GAB1	Q13480	694 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PDK1	Q15118	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CA9	Q16790	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FAR2	Q96K12	515 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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