RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 TIGD1Q96MW7 591 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 GPR137Q96N19 417 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 PWWP2AQ96N64 755 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 VPS35Q96QK1 796 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 SPSB2Q99619 263 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 XKR8Q9H6D3 395 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF711Q9Y462 761 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-222ENST00000449504 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 OR5H15A6NDH6 313 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 MGAT4DA6NG13 374 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 E9PLN8 166 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 H3BMH7 237 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 PRRG2O14669 202 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 AURKAO14965 403 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 GPR39O43194 453 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 MLYCDO95822 493 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 LY6G6DO95868 133 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 HLA-DQB2P05538 268 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 HEXAP06865 529 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 CELA2AP08217 269 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 PRR35P0CG20 571 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 IGFBP2P18065 325 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ITGAXP20702 1163 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 SERPINB6P35237 376 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 SOX5P35711 763 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 SOX11P35716 441 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 NSG1P42857 185 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 OR1D4P47884 311 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 PRKG2Q13237 762 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 BECN1Q14457 450 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ZIC1Q15915 447 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 PCSK7Q16549 785 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF766Q5HY98 468 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 HSCBQ8IWL3 235 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 AMER2Q8N7J2 671 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 PHC3Q8NDX5 983 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 FKBP10Q96AY3 582 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 CRB3Q9BUF7 120 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 WDR54Q9H977 334 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 CBX8Q9HC52 389 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 KLHL1Q9NR64 748 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF358Q9NW07 568 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 FANCLQ9NW38 375 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 STMN3Q9NZ72 180 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 LRFN1Q9P244 771 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 CTSFQ9UBX1 484 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 EDARQ9UNE0 448 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 SPTBP11277 2137 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ADAM10O14672 748 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 MATN3O15232 486 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 TTI1O43156 1089 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ASNA1O43681 348 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 TSPAN12O95859 305 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ALBP02768 609 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 SERPINA7P05543 415 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 MSH3P20585 1137 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 AKT1P31749 480 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 GABRA4P48169 554 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 CACNG1Q06432 222 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF33BQ06732 778 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 MAMLD1Q13495 774 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 PPP2R5EQ16537 467 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-222ENST00000449504 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.88□□□□□ -1.31
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