RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa11.36□□□□□ -0.59
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PRAME-210ENST00000442481 LRBAP50851 2863 aa11.34□□□□□ -0.59
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PRAME-210ENST00000442481 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.34□□□□□ -0.59
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PRAME-210ENST00000442481 ESYT3A0FGR9 886 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 OR5K3A6NET4 321 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 C9J4A7 227 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 IPO13O94829 963 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TIAF1O95411 115 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CD63P08962 238 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 BRAFP15056 766 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ADRA1DP25100 572 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 COL8A1P27658 744 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
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