RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439512.5

TOM1-207, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 3

Gene TOM1, Length 800 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-207ENST00000439512 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.01■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SLC41A2Q96JW4 573 aa16.01■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 OR6C1Q96RD1 312 aa16.01■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.01■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.01■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.01■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 NBEAQ8NFP9 2946 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 MATN2O00339 956 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 KDM1AO60341 852 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 RPN2P04844 631 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 LIPCP11150 499 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 CDH3P22223 829 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SHMT2P34897 504 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 HSD11B2P80365 405 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 KCNAB1Q14722 419 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 TTC23LQ6PF05 361 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 ZBTB2Q8N680 514 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 ZPBPQ9BS86 351 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 PLAC1Q9HBJ0 212 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 LATS2Q9NRM7 1088 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 ACTR10Q9NZ32 417 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 WHRNQ9P202 907 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 CIDEBQ9UHD4 219 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 POMT2Q9UKY4 750 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 LHX6Q9UPM6 363 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 NFS1Q9Y697 457 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SDK2Q58EX2 2172 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa16■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 PIPSLA2A3N6 862 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 C2orf74A8MZ97 194 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 STMND1H3BQB6 276 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 FOLR1P15328 257 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 IL11RAQ14626 422 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 ACSBG2Q5FVE4 666 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 DUPD1Q68J44 220 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 DTX1Q86Y01 620 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 KMT5CQ86Y97 462 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 FBXO36Q8NEA4 188 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 RNF31Q96EP0 1072 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 CERS2Q96G23 380 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 FOPNLQ96NB1 174 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 KLHL25Q9H0H3 589 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 C1GALT1Q9NS00 363 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 OR6C2Q9NZP2 312 aa15.99■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 AHSGP02765 367 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 EBLN1P0CF75 366 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 GABRB3P28472 473 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 CLCN7P51798 805 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 CXADRP78310 365 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 KYNUQ16719 465 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 STEAP4Q687X5 459 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 RASGRP3Q8IV61 690 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 CARFQ8N187 725 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 D2HGDHQ8N465 521 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 INPP5DQ92835 1189 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SLC30A3Q99726 388 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SPRY4Q9C004 299 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 RAB17Q9H0T7 212 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 PDE7BQ9NP56 450 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 GRHL1Q9NZI5 618 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 SLC39A10Q9ULF5 831 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 MED16Q9Y2X0 877 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 COMMD10Q9Y6G5 202 aa15.98■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 ISM1B1AKI9 464 aa15.97■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 E7ESA3 106 aa15.97■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 MAP3K7O43318 606 aa15.97■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 STK17BO94768 372 aa15.97■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 C1orf105O95561 183 aa15.97■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 TUBB4AP04350 444 aa15.97■□□□□ 0.15
TOM1-207ENST00000439512 FGF5P12034 268 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms