RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 MANBAO00462 879 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJA2O60884 412 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 P2RY2P41231 377 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SLC6A12P48065 614 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 EMX2Q04743 252 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CNTN1Q12860 1018 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PAGE3Q5JUK9 113 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CDKL4Q5MAI5 379 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 LPCAT4Q643R3 524 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA24Q86W54 205 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ASB9Q96DX5 294 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PP18 115 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 HNMTP50135 292 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 RAB30Q15771 203 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CYP20A1Q6UW02 462 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ACTL8Q9H568 366 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 GULP1Q9UBP9 304 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC154A6NI56 674 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 NME4O00746 187 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 GSTM1P09488 218 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 BDKRB1P46663 353 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 GSTM4Q03013 218 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SLAMF8Q9P0V8 285 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CD300AQ9UGN4 299 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 QSOX1O00391 747 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SLC16A5O15375 505 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 RGS14O43566 566 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 NEK2P51955 445 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 GRIK2Q13002 908 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PTGR1Q14914 329 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 IZUMO2Q6UXV1 221 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2R1Q6VVX0 501 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CHPFQ8IZ52 775 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC58Q96CX6 371 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ZIM2Q9NZV7 527 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PEX2P28328 305 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 AP1S2P56377 157 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 IMPG1Q17R60 797 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SLC5A10A0PJK1 596 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF4O60810 478 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V1C1P21283 382 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 NFYCQ13952 458 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJB14Q8TBM8 379 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PPP3R2Q96LZ3 170 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SEC22BO75396 215 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PDYNP01213 254 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 LAMP2P13473 410 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PFN3P60673 137 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TRIP10Q15642 601 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 GLMNQ92990 594 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC11Q9NVH1 559 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 FAM234BA2RU67 622 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SLC6A2P23975 617 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 GRIA2P42262 883 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 PRKG2Q13237 762 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM46Q7Z4K8 759 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 NLRP8Q86W28 1048 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP206Q8IYR0 622 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 USP7Q93009 1102 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-209ENST00000428120 MED8Q96G25 268 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms