RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF549Q6P9A3 640 aa24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CNSTQ6PJW8 725 aa24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC41A2Q96JW4 573 aa24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM167BQ9BTA0 163 aa24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC68Q9H2F9 335 aa24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 POMT2Q9UKY4 750 aa24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 STMND1H3BQB6 276 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 EBLN1P0CF75 366 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 FOLR1P15328 257 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SHMT2P34897 504 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 VASH2Q86V25 355 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 LMNTD2Q8IXW0 634 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB2Q8N680 514 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL25Q9H0H3 589 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ACTR10Q9NZ32 417 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC23Q9UJX2 597 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 NFS1Q9Y697 457 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TEX264Q9Y6I9 313 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFHX4Q86UP3 3567 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 NBEAQ8NFP9 2946 aa24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CHD6Q8TD26 2715 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 C2orf74A8MZ97 194 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 MATN2O00339 956 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 HSD11B2P80365 405 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 UNC5DQ6UXZ4 953 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 DTX1Q86Y01 620 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 BBOF1Q8ND07 529 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ZPBPQ9BS86 351 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PLAC1Q9HBJ0 212 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SOHLH2Q9NX45 425 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SPHK1Q9NYA1 384 aa24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PIPSLA2A3N6 862 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 RPN2P04844 631 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PVRP15151 417 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TMPRSS3P57727 454 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ACSBG2Q5FVE4 666 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 MANEAQ5SRI9 462 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP40Q5TG30 622 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 KMT5CQ86Y97 462 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 RASGRP3Q8IV61 690 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC39Q96DD0 335 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CERS2Q96G23 380 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 IL17FQ96PD4 163 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC30A3Q99726 388 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PRORYQ9H606 182 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 C1GALT1Q9NS00 363 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC17A6Q9P2U8 582 aa24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM1AO60341 852 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD1O60671 282 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 STK17BO94768 372 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF28P17035 718 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 BDKRB1P46663 353 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 UCNP55089 124 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CALCOCO2Q13137 446 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TUBB3Q13509 450 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 IL11RAQ14626 422 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 KYNUQ16719 465 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 DUPD1Q68J44 220 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC23LQ6PF05 361 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC81Q6ZN84 652 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM73Q86UV7 250 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 D2HGDHQ8N465 521 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO36Q8NEA4 188 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 NKD1Q969G9 470 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 FOPNLQ96NB1 174 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 LATS2Q9NRM7 1088 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 OR6C2Q9NZP2 312 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 WHRNQ9P202 907 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PILRAQ9UKJ1 303 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SSUH2Q9Y2M2 353 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT87PA6NCN2 255 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ISM1B1AKI9 464 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 NDC80O14777 642 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 EFSO43281 561 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ST6GAL1P15907 406 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 UGT2B7P16662 529 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP1A2P50993 1020 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CLCN7P51798 805 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms