RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM9SF4Q92544 642 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INPP5DQ92835 1189 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P4HTMQ9NXG6 502 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDOR1Q9UHB4 597 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ICKQ9UPZ9 632 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBFA2T2O43439 604 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCRTR1O43613 425 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IPO13O94829 963 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD63P08962 238 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT2B7P16662 529 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACRV1P26436 265 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCDP81605 110 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPSAP1Q14558 356 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZIC1Q15915 447 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR33Q49SQ1 333 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINA9Q86WD7 417 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VSTM4Q8IW00 320 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RANBP9Q96S59 729 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBL1YQ9BQ87 522 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FERMT1Q9BQL6 677 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEMGNQ9BXL5 484 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP1M1Q9BXS5 423 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OCEL1Q9H607 264 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRPK3Q9UPE1 567 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.72□□□□□ -0.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MACROD2A1Z1Q3 448 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSTM1P09488 218 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS56P0CW18 603 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHMT2P34897 504 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX8P57073 446 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSTM4Q03013 218 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC9A5Q14940 896 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRB2Q5IJ48 1285 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC181Q5TID7 509 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENND5AQ6IQ26 1287 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC5AQ6ZN44 842 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZS92 163 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MICALCLQ6ZW33 695 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TICAM1Q8IUC6 712 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZADH2Q8N4Q0 377 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5AR1Q8NGP9 310 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTL9Q8TC94 416 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT35Q92764 455 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2A14Q96R47 310 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXLNGQ9NUQ3 528 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDYLQ9Y232 598 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NTNG1Q9Y2I2 539 aa12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0J9YY10 115 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H7C0S8 307 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MASP2O00187 686 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNN4O15554 427 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK10O94804 968 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTSBP07858 339 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXL2P58012 376 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP2A13Q16696 494 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf63Q6NUN7 778 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUZD1Q86UP6 607 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN19Q8N6F1 224 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC13Q8NBP0 860 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTERQ96BW5 349 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA13Q96N96 652 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARNT2Q9HBZ2 717 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPHK1Q9NYA1 384 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASF1AQ9Y294 204 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRBAP50851 2863 aa12.7□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCA12Q86UK0 2595 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PJA2O43164 708 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP2A2O94973 939 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UMODP07911 640 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBP3P10745 1247 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLRBP48167 497 aa12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms