RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT33BQ14525 404 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SETDB1Q15047 1291 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCEA2Q15560 299 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 LPAL2Q16609 132 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM61Q5EBN2 209 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHF21BQ96EK2 531 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 L3HYPDHQ96EM0 354 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC134Q9H6E4 229 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCOR1O75376 2440 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 EML2O95834 649 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANXA6P08133 673 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 GGT5P36269 586 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSD17B2P37059 387 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPLP40238 635 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 HERVK_113P63132 956 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHI3L2Q15782 390 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATG16L1Q676U5 607 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGS9BPQ6ZS82 235 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 AVL9Q8NBF6 648 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHC3Q8NDX5 983 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC8CQ8TDW0 803 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBTD2Q8WUN7 234 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFPM2Q8WW38 1151 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXL8Q96CD0 374 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERVK-6Q9BXR3 956 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GTQ1 180 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP33O14559 1287 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 YY2O15391 372 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CER1O95813 267 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINE1P05121 402 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 BGNP21810 368 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINB5P36952 375 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAGLUP54802 743 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP19Q14CB8 494 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 HLA-BQ31612 363 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SFRP1Q8N474 314 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR6Y1Q8NGX8 325 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKP4Q99569 1192 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 POT1Q9NUX5 634 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 WWOXQ9NZC7 414 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA7Q9P0W8 599 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAM21Q9UKJ8 722 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0C4DFX4 3053 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF839A8K0R7 811 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PATE3B3GLJ2 98 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SDC3O75056 442 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC16A8O95907 504 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 STX3Q13277 289 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP157Q5JU67 520 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAGSQ8N159 534 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNDP1Q96KN2 507 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMK1GQ96NX5 476 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM237Q96Q45 408 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 HGH1Q9BTY7 390 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD244Q9BZW8 370 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms