RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 NID2Q14112 1375 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 SLIT3O75094 1523 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 WRBO00258 174 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 S100A1P23297 94 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 GNALP38405 381 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 HERVK_113P63132 956 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ZFP69Q49AA0 526 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 TTLQ8NG68 377 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 FEM1AQ9BSK4 669 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ERVK-6Q9BXR3 956 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PHF24Q9UPV7 400 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 REM1O75628 298 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 INHAP05111 366 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ALDH3A2P51648 485 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 RPS24P62847 133 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ZNF304Q9HCX3 659 aa18.18■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 E7ENX8 843 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 WNT9AO14904 365 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PCDH7O60245 1069 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PGRP06401 933 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 CD2P06729 351 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 IMPDH1P20839 514 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 TYSND1Q2T9J0 566 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 OR13C4Q8NGS5 318 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 RIT1Q92963 219 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 SUV39H2Q9H5I1 410 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ITM2CQ9NQX7 267 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 FAM172BPA6NC97 362 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 HDDC3Q8N4P3 179 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 EFCAB11Q9BUY7 163 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 LRRC3Q9BY71 257 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ATP6V1G1O75348 118 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 TSPAN9O75954 239 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PIGRP01833 764 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ZNF823P16415 610 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 CASP9P55211 416 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 E2F2Q14209 437 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ADGRF1Q5T601 910 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 NUP54Q7Z3B4 507 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 GALNT7Q86SF2 657 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 OR5K1Q8NHB7 308 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 SH3RF2Q8TEC5 729 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PMEPA1Q969W9 287 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 HCN3Q9P1Z3 774 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 A0A1W2PRB8 838 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PRAMEF12O95522 483 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ADGRE1Q14246 886 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 SMARCD3Q6STE5 483 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 SLC22A18Q96BI1 424 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 OSBPL2Q9H1P3 480 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ZNF221Q9UK13 617 aa18.17■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 DUXAA6NLW8 204 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PRPS1L1P21108 318 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 SLC10A7Q0GE19 358 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PITRM1Q5JRX3 1037 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 IQCF2Q8IXL9 164 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 OR10H4Q8NGA5 316 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 GPR151Q8TDV0 419 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 IFT27Q9BW83 186 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 OR51V1Q9H2C8 321 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 TAS2R7Q9NYW3 318 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PTTG2Q9NZH5 202 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 DKK3Q9UBP4 350 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 C9IYK1 514 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PITPNM1O00562 1244 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 TPST2O60704 377 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 GJA9P57773 515 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 VBP1P61758 197 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 KLHL22Q53GT1 634 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 STX12Q86Y82 276 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 EBF3Q9H4W6 596 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 TVP23BQ9NYZ1 205 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 STOML2Q9UJZ1 356 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 SCAMP1O15126 338 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ALPPP05187 535 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 DBIP07108 87 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 CLCN7P51798 805 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 FCGR1BQ92637 280 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 NUS1Q96E22 293 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 COPS4Q9BT78 406 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ILVBLA1L0T0 632 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 AREL1O15033 823 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 ANXA8P13928 327 aa18.16■□□□□ 0.5
USP25-204ENST00000400183 CREB1P16220 341 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms