RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 RPE65Q16518 533 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 PFKFB4Q16877 469 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 DLG3Q92796 817 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 FBXL8Q96CD0 374 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 CCDC134Q9H6E4 229 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 CAPN10Q9HC96 672 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 POT1Q9NUX5 634 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 SPATA7Q9P0W8 599 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 ST14Q9Y5Y6 855 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 R4GN57 208 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-202ENST00000397396 NEMP2A6NFY4 417 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 LMO7DNF2Z398 122 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 DLL1O00548 723 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 KLF11O14901 512 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CER1O95813 267 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 SERPINE1P05121 402 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ANXA6P08133 673 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 SERPINB5P36952 375 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 MPLP40238 635 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 BDKRB1P46663 353 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 GRIK2Q13002 908 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 SETDB1Q15047 1291 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 UBTD2Q8WUN7 234 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ZFPM2Q8WW38 1151 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 FERD3LQ96RJ6 166 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 MECRQ9BV79 373 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 WWOXQ9NZC7 414 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 WDR91A4D1P6 747 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 GUCA1CO95843 209 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 IMPDH1P20839 514 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 HERVK_113P63132 956 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 C1orf61Q13536 156 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ARHGAP19Q14CB8 494 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CLCA4Q14CN2 919 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CFAP157Q5JU67 520 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 IYDQ6PHW0 289 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 RHBDF1Q96CC6 855 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 PHF21BQ96EK2 531 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 L3HYPDHQ96EM0 354 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 MANSC1Q9H8J5 431 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 BNC1Q01954 994 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 GUCY1A3Q02108 690 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CHI3L2Q15782 390 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 TRMOQ9BU70 441 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 KCNH6Q9H252 994 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 A0A1B0GTQ1 180 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM114B3SHH9 223 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 PIK3CGP48736 1102 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.264e-6■■■■□ 22.4
TSPAN4-202ENST00000397396 TCEA2Q15560 299 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 LPAL2Q16609 132 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ANKS6Q68DC2 871 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 PKP4Q99569 1192 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CACNA1EQ15878 2313 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 ARHGAP33O14559 1287 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 NPHS1O60500 1241 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 VIPP01282 170 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 RETP07949 1114 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 BGNP21810 368 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-202ENST00000397396 GGT5P36269 586 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms