RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 GMNNO75496 209 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 BCL10O95999 233 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 G6PDP11413 515 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ACRV1P26436 265 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 GSTM2P28161 218 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 MTHFRP42898 656 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 VEGFBP49765 207 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF2H2Q13888 395 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC23Q5W5X9 447 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP20A1Q6UW02 462 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 HTR3DQ70Z44 454 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 OR4F6Q8NGB9 312 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 SDCCAG3Q96C92 435 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 TOX2Q96NM4 488 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 UGT2B28Q9BY64 529 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ELOVL2Q9NXB9 296 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 GNPTGQ9UJJ9 305 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 PSME2Q9UL46 239 aa23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 LTBP2Q14767 1821 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 TAPBPO15533 448 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM16O95361 564 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 GUCA1CO95843 209 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 ITGALP20701 1170 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 SEMG2Q02383 582 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 EPS8Q12929 822 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 SPIDRQ14159 915 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 CHRNA6Q15825 494 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPAN33Q86UF1 283 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 PAF1Q8N7H5 531 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 LHPPQ9H008 270 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 GORASP2Q9H8Y8 452 aa23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA8CPA6NN73 597 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 C16orf96A6NNT2 1141 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD28O15084 1053 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 PCNAP12004 261 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 CCL5P13501 91 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 GJA1P17302 382 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 NFKBIAP25963 317 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 CSNK1DP48730 415 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHG6Q3KR16 790 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 IL27RAQ6UWB1 636 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 FKBP9P1Q75LS8 142 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF583Q96ND8 569 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 ADNPQ9H2P0 1102 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 TOR3AQ9H497 397 aa23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 G3V2T6 193 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 LSM1O15116 133 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 LILRB3O75022 631 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 SOCS5O75159 536 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 KATNA1O75449 491 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 OCM2P0CE71 109 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 LAG3P18627 525 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 JAK1P23458 1154 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 HSPA7P48741 367 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAF3Q13114 568 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 PHKG1Q16816 387 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 TMC8Q8IU68 726 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCB8Q9NUT2 735 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 RAD51BO15315 384 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 TGM5O43548 720 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 STK19P49842 368 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPK10P53779 464 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC44A4Q53GD3 710 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 CPXM2Q8N436 756 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM118AQ9NWS6 357 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJB9Q9UBS3 223 aa23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 CLPXO76031 633 aa23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNH1O95259 989 aa23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 GLUD1P00367 558 aa23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 PORP16435 677 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 DGKQP52824 942 aa23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC7A9P82251 487 aa23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 ABRAXAS2Q15018 415 aa23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 NR6A1Q15406 480 aa23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1-201ENST00000369862 GPRC6AQ5T6X5 926 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms